Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb7P09024 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms