Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spta1P08032 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms