Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PdgfrbP05622 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PdgfrbP05622 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PdgfrbP05622 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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