Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms