Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tgfb1P04202 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tgfb1P04202 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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