Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01647 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01647 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01647 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01647 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms