Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CcnkO88874 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CcnkO88874 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CcnkO88874 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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