Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shoc2O88520 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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