Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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CntfrO88507 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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CntfrO88507 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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CntfrO88507 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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CntfrO88507 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntfrO88507 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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CntfrO88507 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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CntfrO88507 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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CntfrO88507 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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