Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Kcnk4O88454 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Kcnk4O88454 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Kcnk4O88454 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Kcnk4O88454 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Kcnk4O88454 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Kcnk4O88454 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Kcnk4O88454 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Kcnk4O88454 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Kcnk4O88454 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk4O88454 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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