Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms