Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms