Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prom1O54990 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prom1O54990 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms