Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ChkaO54804 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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