Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Limk2O54785 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Limk2O54785 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Limk2O54785 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Limk2O54785 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Limk2O54785 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Limk2O54785 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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