Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Bnc1O35914 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Bnc1O35914 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Bnc1O35914 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bnc1O35914 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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