Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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