Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnih1O35372 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms