Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn9O35239 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms