Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms