Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MsmbO08540 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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