Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms