Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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BC024978J3QPC3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BC024978J3QPC3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC024978J3QPC3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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BC024978J3QPC3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC024978J3QPC3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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