Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Gm20918J3QN17 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Gm20918J3QN17 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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