Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms