Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf148G3X9R7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf148G3X9R7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf148G3X9R7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf148G3X9R7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf148G3X9R7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf148G3X9R7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf148G3X9R7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf148G3X9R7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms