Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nccrp1G3X9C2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nccrp1G3X9C2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nccrp1G3X9C2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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