Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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