Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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