Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20671F6TVX7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm20671F6TVX7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm20671F6TVX7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20671F6TVX7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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