Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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TrdnE9Q9K5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TrdnE9Q9K5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrdnE9Q9K5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms