Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ankrd35E9Q9D8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd35E9Q9D8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms