Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Urb2E9Q7L1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms