Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC030500E9Q6W0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms