Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0X2

Apold1, Apolipoprotein L domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apold1E9Q0X2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apold1E9Q0X2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apold1E9Q0X2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms