Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm5415E9PXF3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms