Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30bE9PVL6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms