Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms