Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms