Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms