Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms