Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3543D3Z235 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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