Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd1D3YXK1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms