Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms