Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms