Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik3B1AS29 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms