Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms