Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf2A3KGV1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms