Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms