Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp8b5A3FIN4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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